在生命科学研究中，细胞的空间位置信息是理解组织功能、疾病机制和发育过程的关键。锘海生命科学凭借组织透明化3D成像技术，为科研工作者提供从样本处理、高分辨率成像到数据分析的一站式解决方案，助力探索生命科学的微观宇宙！锘海生命科学最新推出单细胞空间多组学与高通量蛋白质组学检测服务，依托空间组学、单细胞多组学及高通量蛋白质组学技术平台，结合组织透明化3D荧光成像技术，为肿瘤、免疫、神经、发育、慢性疾病及大队列研究提供从样本制备、多维解析到深度数据挖掘的全链条解决方案。
为什么选择空间组学？
生命体的复杂性源于细胞在组织中的空间异质性。传统技术虽能解析基因或蛋白表达，却无法保留空间位置信息。空间组学通过原位检测单细胞/多细胞的基因、蛋白表达谱，结合空间坐标，揭示细胞间相互作用、微环境特征及疾病机制。这一技术被《Nature》《Science》等顶级期刊评为“年度技术”，并成为临床病理、肿瘤免疫、神经科学等领域的核心工具。
01创新空间多组学技术平台
打造创新空间多组学技术平台，覆盖RNA、蛋白、代谢等多维度分析，兼容FFPE、冷冻样本等多种类型，为科研提供精准、高效的支持。
1. CosMxTM SMI单细胞空间原位分子成像平台
超高分辨率：亚细胞级分辨率（纳米级），实现单细胞及亚细胞水平的RNA/蛋白原位可视化。
多靶标检测：支持6000种RNA+64种蛋白同时检测，覆盖肿瘤、神经、免疫等研究需求。
智能分析：AI算法精准识别细胞边界，结合聚类、差异表达、细胞通讯分析，揭示组织微环境奥秘。
应用案例：已支持150+研究项目，发表30+高分文章，在脑科学、肿瘤异质性等领域成果显著。
2. GeoMxTM DSP数字空间组学平台
灵活圈选：通过几何、网格、形态学标记等方式精准定位目标区域（ROI），解析组织异质性。
多组学整合：单张切片同步检测RNA（全转录组）和蛋白（100+靶标），释放样本最大价值。
临床适配：兼容FFPE样本，适用于癌症、感染性疾病、发育生物学等研究，数据与RNA-seq高度一致。
3. 10x Visium CytAssist空间转录组测序
样本友好：支持存档玻片、染色切片，DV200＞30%即可检测，突破传统技术限制。
高灵敏度：RTL探针设计覆盖90%基因，单细胞分辨率揭示转录组空间图谱。
大视野成像：11×11mm芯片兼容大面积组织，适用于脑区、肿瘤微环境等复杂结构解析。
4. 深度空间蛋白组（LCM + timsTOF Pro）
非靶向检测：激光显微切割（LCM）精准捕获目标区域，4D质谱技术无偏分析数千种蛋白。
微量样本：离子淌度分离技术提升灵敏度，0.1mm2组织即可获得高质量数据。
多组学联动：与GeoMxTM DSP联合，实现转录组-蛋白组空间共定位，挖掘关键调控网络。
02成功案例：空间组学驱动科研突破
案例分析-SMI
研究设计
在组织空间维度全面揭示了巨噬细胞的多样性和可塑性，结果发现巨噬细胞和炎性成纤维细胞参与构建了强大的通讯网络，阐释了人类炎性肠病的细胞复杂性和导致IBD异质性的潜在机制。
案例分析-DSP
DSP（1个SLS+1个IS）：探究肿瘤空间微环境
本研究提示mTORC1高活性的干细胞样状态肿瘤细胞通过免疫抑制，存在一种自分泌雷帕霉素耐药机制和旁分泌肿瘤生存机制。
03空间转录组数据分析展示-基础分析
聚类分群在 H&E 染色图上的分布
分群可视化图（TSNE/UMAP）
特定marker的空间分布组织图
组织扫描荧光图
细胞类型统计图
04空间转录组数据分析展示-高级分析
1、Spatial PCA：增加空间聚类准确性
Spatial PCA是一种空间的降维方法，建立在PCA的基础上，将定位信息作为额外的输入，并使用核矩阵来明确地模拟不同组织位置的空间相关结构。
2、BayesSpace：增加空间分辨率
BayesSpace，一种完全贝叶斯统计方法，通过使用来自空间邻域的信息来增强空间转录组数据的分辨率并进行聚类分析，能够有效识别具有相似表达谱的空间簇以及提高空间转录组学分辨率。
3、CellTrek：根据scRNA-seq和ST数据直接将单个细胞映射到组织切片的空间坐标
4、Cell2location：将单个细胞参考细胞类型映射到空间转录组数据集
5、SPOTlight：识别每个spot中的细胞类型和比例
6、SMI数据基因共表达分析
7、SMI数据基因共表达分析
05SBC ToolBox 生信分析云平台
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